Во время операции «Буря в пустыне» F-15E использо­вались для борьбы с ракетными комплексами «Scud» и даже с вертолетами. Strike Eagle снова вступили в бой над Балканами в середине 1990-х, затем в Афганистане в 2001 году, а в 2003 году снова вернулись в Ирак.

Ко времени операции «Буря в пустыне» F-15E лишь недавно были приняты на вооружение, их экипажи еще мало освоили возможности своих машин, а выбор доступного вооружения был сильно ограничен. Тем не менее в ходе операций «Щит пустыни» и «Буря в пустыне» были потеряны всего три самолета, причем один из них — в ходе подготовки к войне.

Во время учебного воздушного боя с британским Jaguar на нисходящих, F-15E столкнулся с землей. Причиной сочли недостаточную подготовку пилота, еще не имевшего необходимого опыта полетов на F- 15Е с подвесными баками. В ходе конфликта жертвой противника стали еще два F-15E, а общее число потерянных членов экипажей возросло до четырех.

Нехватка вооружения

Когда F-15E были развернуты на Ближнем Востоке, к применению был допущен лишь ограниченный набор вооружения. Но технические специалисты несколько расширили этот список. Типичная боевая нагрузка включала обычные бомбы Мк 80 и кассетные боеприпасы. Хотя самолеты могли использовать бомбы с лазерным наведением, к началу кампании прицельных контейнеров LANTIRN доставить не успели, и на первом этапе войны F-15E летали лишь с навигационными контейнерами. Позднее, когда прибыло небольшое число контейнеров, Strike Eagle работали парами — один самолет осуществлял целеуказание и для своих бомб, и для бомб ведомого.